Setelah lima tahun memendam perasaan yang tak terucapkan, Taiju Ooki, seorang siswa SMA, akhirnya siap untuk menyatakan cintanya kepada Yuzuriha Ogawa. Namun, tepat ketika Taiju memulai pengakuannya, cahaya hijau yang menyilaukan menyinari Bumi dan membatukan umat manusia di seluruh dunia—mengubah setiap manusia menjadi batu.
Beberapa milenium kemudian, Taiju terbangun dan mendapati dunia modern sama sekali tidak ada, karena alam telah berkembang pesat selama bertahun-tahun umat manusia terhenti. Di antara dunia batu yang dipenuhi patung, Taiju bertemu dengan manusia lain yang masih hidup: sahabatnya yang mencintai sains, Senkuu, yang telah aktif selama beberapa bulan. Taiju mengetahui bahwa Senkuu telah mengembangkan rencana besar—untuk meluncurkan kebangkitan peradaban sepenuhnya dengan sains. Kekuatan Taiju dan otak Senkuu bergabung untuk menjalin kemitraan yang tangguh, dan mereka segera menemukan metode untuk menghidupkan kembali mereka yang membatu.
Namun, rencana induk Senkuu terancam ketika ideologinya ditantang oleh mereka yang terbangun. Sementara itu, alasan umat manusia membatu masih belum diketahui.
